Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USP20Q9Y2K6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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