Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MED23Q9ULK4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MED23Q9ULK4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms