Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms