Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
REREQ9P2R6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
REREQ9P2R6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms