Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPAQ9P0L0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms