Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CNIH4Q9P003 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CNIH4Q9P003 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNIH4Q9P003 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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