Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RLIMQ9NVW2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms