Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG3Q9NT62 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms