Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB6BQ9NRW1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms