Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MTMR12Q9C0I1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTMR12Q9C0I1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms