Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYM8

RBCK1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1Q9BYM8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBCK1Q9BYM8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBCK1Q9BYM8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms