Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABARAPL3Q9BY60 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GABARAPL3Q9BY60 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms