Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms