Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms