Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KATNB1Q9BVA0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms