Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LIMD2Q9BT23 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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