Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCNX1Q96RV3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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