Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
UBE2E2Q96LR5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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UBE2E2Q96LR5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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UBE2E2Q96LR5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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