Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCE1Q969G3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms