Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX33Q8WV41 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms