Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C17orf47Q8NEP4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms