Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms