Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP13Q86W25 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP13Q86W25 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms