Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC84Q86UT8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms