Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX20Q7Z614 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms