Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms