Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NANOGP8Q6NSW7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms