Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM208BQ5VWN6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms