Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C9orf135Q5VTT2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms