Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDZK1Q5T2W1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms