Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL12Q53G59 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms