Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKDCCQ504Y2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms