Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC36A3Q495N2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms