Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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KRTAP21-3Q3LHN1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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KRTAP21-3Q3LHN1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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KRTAP21-3Q3LHN1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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KRTAP21-3Q3LHN1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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KRTAP21-3Q3LHN1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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KRTAP21-3Q3LHN1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
KRTAP21-3Q3LHN1 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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