Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC96Q2M329 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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CCDC96Q2M329 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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CCDC96Q2M329 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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CCDC96Q2M329 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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CCDC96Q2M329 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC96Q2M329 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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