Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MICAQ29983 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MICAQ29983 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MICAQ29983 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms