Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC142Q17RM4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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