Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
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PTPROQ16827 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PTPROQ16827 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PTPROQ16827 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PTPROQ16827 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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PTPROQ16827 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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PTPROQ16827 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTPROQ16827 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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