Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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