Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLPPQ16740 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms