Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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HIST3H3Q16695 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HIST3H3Q16695 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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