Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CDKN3Q16667 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CDKN3Q16667 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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