Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF239Q16600 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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