Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX1Q16384 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX1Q16384 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms