Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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