Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F4Q16254 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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