Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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