Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITSN1Q15811 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
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