Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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TRIP10Q15642 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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TRIP10Q15642 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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TRIP10Q15642 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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TRIP10Q15642 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TRIP10Q15642 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TRIP10Q15642 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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TRIP10Q15642 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIP10Q15642 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms