Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SYCP1Q15431 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms